給与計算・年末調整に関する質問｜質問No.12367

個人事業主で免税事業者です。源泉が引かれていない場合

妻の相談です。
妻は個人事業主で免税事業者です(インボイス登録なし)
舞台関係で出演したりスタッフしたりの仕事です。

仕事を終え、源泉引かれる事に了承済の請求書を出したところ、発注元(納税事業者　インボイス登録あり)から、引かれていない金額が振り込まれました。

返還を申し出たところ、今回は大丈夫ですとの回答を頂きました。

取引先とも良い関係を続けたいので、ご迷惑をお掛けしたくないのですが、どのように対応するのが良いか、困っています。