給与計算・年末調整に関する質問｜質問No.1396

年末調整の還付の時期と方法について

退職し起業しました。まだ税理士さんはおりません。前職での納税が多く、freee人事労務で年末調整を算定した所、100万円以上の還付が受けられる事になりました。
現在は起業した自分の会社から給与を受け取っていますので（会社から）還付を実行しても、この会社ではその後の納税での差し引き相殺が長らくできない見込みです。　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　
　　１．起業した会社で還付を行った場合、なんらかの手続きで会社へ現金の還付を行う方法はありますか？　またその還付を受ける時期はどうなりますでしょうか？　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　２．私自身だけ個別に年末調整をせずに、個人として確定申告で還付を受ける方法はありますか？　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　医療費控除を行うため確定申告は苦ではないですが、年収は2000万以下なので確定申告対象にはなっていません。（freeeでは還付対象反映しない設定にする？？）できれば２の方法をとりたいのですが、どうすればよろしいでしょうか？