経理・記帳・仕訳に関する質問｜質問No.18958

卸店から発行される明細書と実際の支払額の相違について。

海外の卸売店から輸入して、日本で販売するネットショップを経営しております。
問題点として、卸店から発行されるオーダー明細書と実際の支払額にズレが生じています。
ズレの生じる背景として、卸店から発行される明細書には決済手数料が記載されていませんが、実際に支払い時には3.6%を加算されてしまうため、明細書の金額とクレジットカードでの実際の支払額にズレが生じてしまいます。

支払い完了後に送付されてくるメールには支払い金額、支払い先の卸売店名、金額、日付などが記載されておりますが、購入した商品の詳細が載っていません。

確定申告は税理士の先生に丸投げでお任せする予定ですが、どちらの領収証を取っておけば良いでしょうか？
経営1年目で初歩的な質問となりますが、よろしくお願いいたします。