【源泉徴収】デザイン報酬の源泉徴収漏れ（請求額間違い）が発覚しました。対応することを教えてください。
個人事業主です。主たる収入はデザイン業による収入です。
日々の経理業務や確定申告等はfreeeを活用しております。税務顧問はつけていません。
2022年11月頃から現在まで（満6ヶ月）、企業1社と業務委託契約を結びました。
報酬は一ヶ月10万(消費税別)です。業務内容はデザイン制作業務（7割）、イベント企画相談・事務雑務等（3割）を担うというものです。
翌月10日までに私から企業へ請求書を（freeeにて）発行し、翌月末に振込をしていただいています。
報酬は毎回きちんと契約金額通りに支払われていますが、その報酬額から源泉徴収されていないことが最近発覚しました。
（この旨は企業側へ報告済み。顧問税理士と相談しますとの回答があり、その後待ちの状態）
（なお、上記問題点が発生した原因は両者間での知識・確認不足等様々あります）
現在起きている問題点としては上記の通りですが、私の方でも対応すべきことを整理・把握しておきたく質問させていただいた次第です。
１）［企業側へ提示された額を返金した後、私の方では確定申告書の修正→税務署へ提出する工程が発生する］という左記の認識であっていますでしょうか？
２）［freee上で何の項目をどのように修正すべきか］がわかっていません。ざっくりとでも構いませんのでご教示いただけると助かります。
どうぞよろしくお願いします。
