確定申告に関する質問｜質問No.19228

確定申告の方法により納税額が変わりますか？（直接税務署に行った同期と比べてeーTAXで納税した私のほうがかなり多くて不公平感と不信感がある）

６５歳元公務員です。
２歳年上の同期と比べて納税額が多いと言われました。
２人とも６０歳で定年退職し、その後再就職しています。
相手は現在の収入が多く年金を一部カットされています。
私は収入が少なく年金をカットされていません。
先日確定申告の話になり私が約９万円の納税であったと言ったら彼は「それはおかしい。私の方が収入が多いけど私は３万円程度の納税額だった。一度税務署に相談した方よいのでは？」と言われました。
私はスマホとマイナンバーカードでeーTAXを使って納税しました。同期生は直接税務署に行って計算してもらったそうです。
そんなに違うのであれば次回から直接税務署に行こうと思います。
凄い不公平感と不信感を感じています。
直接税務署に行くのとeーTAXで納税するのと違いがあるのですか？